繁华大都会美国纽约，邪恶领袖施莱德率领的大脚帮在城市内为非作歹，甚嚣尘上。安保公司老板埃里克·萨克斯（威廉·菲德内尔 William Fichtner 饰）推出最新安保系统，发誓维护城市的和平。第6频道女记者爱普尔·奥尼尔（梅根·福克斯 Megan Fox 饰）偶然拍到大脚帮被四名神秘侠客挫败的画面，在第二次遭遇非常事件时，她惊讶地发现四名侠客竟然是变异后的巴西龟：拉斐尔、列奥纳多、米可朗基罗、多纳泰罗。忍者神龟的名字勾起了爱普尔儿时的记忆，当年她的父亲与萨克斯正是研究生物变异实验的伙伴。她将这个消息告诉给萨克斯，可是在和忍者神龟及其老师斯普林特会面后，才发觉萨克斯与施莱德是这座城市内的罪恶之源…… 本片根据同名经典漫画改编。
在去森林里露营的途中，小男孩肖恩（瑞克·斯克路德 Rick Schroder 饰）同父母一起遭遇了可怕的车祸，在车祸中，肖恩的父母双双身亡，不知是幸还是不幸，肖恩活了下来。在偌大的原始森林里，小小的男孩形单影只的徘徊着。这一切都被帕特瑞克（威廉·霍尔登 William Holden 饰）看在眼里。帕特瑞克对自己的重病心知肚明，也明白自己已经时日无多，所以他来到此处，希望能在故乡的土地上安然长眠。 就这样，属于帕特瑞克和肖恩的旅程开始了，一个走向新生，而另一个走向终结。在旅程中，帕特瑞克不断的向肖恩传授着在丛林里生存下去的要诀，而肖恩也在学习的同时不断的磨练的内心。一段旅途两个终点，他们能够顺利抵达各自的目的地吗？
