高坂贤吾（林遣都 饰）是一个看上去非常阴沉的青年，因为患有非常严重的洁癖症，所以贤吾无法与其他人正常的交往，这让贤吾感到非常的痛苦。一天，一个神秘的男人找到了贤吾，交给了他一个特殊的委托，一位名叫佐薙圣（小松菜奈 饰）的女高中生因为患有视线恐惧症而不愿意去学校，神秘男子希望贤吾能够帮助这位女孩。 刚开始，阿圣对于贤吾的关注反应非常的抗拒，对他恶语相向，态度十分糟糕，但很快，与阿圣有着相似经历的贤吾就明白了，这种攻击性，只不过是阿圣自我保护的一种方式而已，这种方式他自己也非常的熟悉。渐渐地，贤吾和阿圣之间的距离渐渐靠近。
这两位宛如神衹一般强大的对手于一场壮观的战争中相遇，彼时世界命运正悬于一线。为了找到真正的家园，金刚与他的保护者们踏上了一次艰难的旅程。与他们一道前行的还有一个年轻的孤儿女孩——吉雅，这个女孩与金刚之间存在着一种独特而强大的紧密联系。但意想不到的是，他们在前行的航道上与愤怒的哥斯拉狭路相逢，也由此在全球引起了一系列破坏。一股无形的力量造成了这两只巨兽之间的巨大冲突，深藏在地心深处的奥秘也由此揭开。
